Der 30-jährige Krieg brachte auch nach Thaining viel Leid, besonders als im Dezember 1633 die Pest von Soldaten eingeschleppt wurde. Im Verlauf des Jahres 1634 starben daran 279 von den 352 Einwohnern. Ein zweites Mal wütete die Pest 1649, daraufhin wurde ein Bittgang nach Hagenheim verlobt.